上海市肺科医院胸外科创建于 1953 年，目前为上海市临床医学重点学科，国家重点临床专科，至今已实施各类胸外科手术50000余例。目前拥有4个病区及2个监护病房，床位共200余张，年手术量达8300余例。现有各级医师44名，其中副主任医师以上18名，教授3名，博导3名，硕导7名；博士后1名，博士13名，硕士18名。目前该科姜格宁教授获得卫生部有突出贡献的中青年专家，上海市领军人才，上海市医学领军人才，1人获得上海市医苑新星，1人入选上海市卫生局新百人计划，2人入选上海市启明星计划，1人入选上海市人才计划。
该中心以胸部肿瘤的临床诊治为重点，在肺结核、气管外科、食管良恶性疾病、纵隔肿瘤等方面开展了大量的工作，尤其是近几年在肺癌的综合治疗、微创胸外科手术、肺移植、气管外科以及难治性脓胸等领域取得了新的成绩，确立了学科在国内的领先地位：该中心已成为国家重点临床专科，上海市重点学科，复旦大学医院管理研究所发布的“中国医院最佳专科声誉排行榜”中，该中心，2011、2012年连续2年位列普胸外科第二名，2013年位列第三名。
一、学科水平
该中心的学科特色包括：胸部疾病的微创治疗，终末期肺病的外科治疗，气管外科治疗，肺癌外科的综合治疗，以及难治性脓胸的外科治疗等。
1. 胸部疾病的微创治疗
1993年开始在国内率先开展胸腔镜肺外科治疗，2004至2013年胸腔镜手术总数达11000余例；目前胸腔镜手术比例达85%以上；该中心胸腔镜手术例数逐年递增，近年来胸腔镜手术量，单孔胸腔镜手术量稳居全国首位。在国内率先开展单孔VATS肺叶切除术、剑突下同期双侧肺切除手术、同期双侧VATS肺叶切除术、单孔VATS肺段切除术、VATS袖式肺切除术、VATS全肺切除术以及经颈胸腺肿瘤切除术等复杂微创外科手术。此外，在国内率先开展EBUS及电磁导航支气管镜，且完成EBUS例数国内最多。取得了多项胸腔镜器械发明专利及降低手术费用的技术改进；并根据国内胸腔镜开展现状，率先提出了上海市肺科医院胸腔镜手术质量控制标准，取得了较好的社会效应。撰写论著17篇，其中4篇发表于国际期刊（SCI收录）；获得胸腔镜相关课题4项，项目资金224万;主编、副主编或参编胸腔镜微创相关内容专著9本。
2.终末期肺病的外科治疗
1996年，在国内率先开展肺减容，治疗重度肺气肿，获1998年上海市临床医疗成果二等奖。该中心1978年开始肺移植动物实验，2003年率先开展了肺移植的临床工作，目前共实施了90余例次肺移植，包括单肺移植、双肺移植、肺再移植以及活体肺叶移植，是国内唯一开展了所有肺移植术式的医院，肺移植存活率国内领先，并接近欧美发达国家水平，该项目2005年荣获上海市科技成果二等奖，2006年荣获教育部科技进步二等奖，2012年荣获中华医学科技奖二等奖。受中华医学会器官移植分会委托，该中心起草制定了中国《临床肺移植应用技术规范》，肺移植手术类型开展最全面，包括小儿肺移植、高龄肺移植、单肺移植、双肺移植、活体肺叶移植、肺再移植术、ECMO在肺移植中的应用。上海市肺科医院获得肺移植相关课题18项，包括2项国家自然科学基金项目，1项国际合作项目，2项上海市科委重大项目，2项上海市启明星计划，不包括匹配共430万，获得新型实用专利1项，发表肺移植相关论文68篇，包括中华论文43篇，SCI论文7篇，总引用次数