医院建成于1921年，由洛克菲勒基金会创办。建院之初，就志在建成亚洲最好的医学中心。新中国成立后，协和的发展建设得到了历届党和国家领导人的高度重视和大力支持。90年来，医院始终拥有一支以优秀的临床医学家、医学教育家和医学科学家为骨干的专业人才队伍，培养和造就了张孝骞、林巧稚等一代医学大师和多位中国现代医学的领军人物，并向全国输送了大批的医学管理人才，当今知名的10余家大型综合、专科医院都是由协和人创建的。在长期的发展过程中，形成了独特的文化和优良传统以及“严谨、求精、勤奋、奉献”的协和精神。“教授、病案、图书馆”是著名的协和“三宝”，现代医学教育的“三基”、“三严”理念起源于协和。
医院学科齐全、技术力量雄厚、特色专科突出，以多学科综合优势享誉海内外。2002年与合并重组，形成东单和西单两个院区，总建筑面积17余万平方米。2010年12月27日，干部保健基地启用。年内，新门急诊楼及手术科室楼建成并将投入使用，届时医院总建筑面积达到53万余平方米，将进一步全面提升就医环境。近年来，通过学科规划和资源整合，形成了东院以“大医疗为主体”、西院以“大专科、小综合”为特色的医疗格局。
医院现有在职职工4000余人，其中两院院士6人、正副教授682人；中华医学会、北京医学会及其它学会前任主委、现任主任、副主任委员及侯任主任60名，中文核心杂志正副总编及名誉主编60余人；设立临床、医技科室54个，开放住院床位2000余张，国家临床重点专科14个、国家级重点学科20个、北京市重点学科5个；日门诊量1.2万人次，年出院病人6.8万人次，住院手术病人3.2万人次，平均住院日9.5天以下。
现有博士生导师104人、硕士生导师214人，博士点14个、硕士点21个，国家级继续医学教育基地6个、二级学科住院医师培养基地14个、三级学科专科医师培养基地14个，每年严格遴选、接收来自全国各地的进修医师700余名、进修护士及专科培训学员600余名。2009年9月19日，普通外科专科医师培训中心通过英国爱丁堡皇家外科学院与香港外科医学院认证。目前，正在积极筹建国家级住院医师培训基地。北京儿童医院知名专家大全