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套筒补偿器的密封件也是经过多年的经验改进了出了两种密封方式套筒补偿器的密封结构有两种，填料密封及机械密封。机械密封在以前使用在旋转轴上的密封技术，通过一对或多对垂直旋转轴端面，在液压和外力弹力之下，与另一面保持均匀贴合，相对滑动从而达到防治液体泄漏的装置，这种技术也叫端面密封。这种技术需要很高的精度配合，成本上也增加不少，在上世纪90年代曾经推出过这种工艺的套筒补偿器，虽然当时是极为简单的结构，但弹簧的增设让密封填料始终在被压紧的状态之下，达到无介质泄漏目的。
填料密封作为一种接触式的密封方式，通过在外套管和内部芯管之间加入弹性密封的材料。填料在其中会受到轴向力然后被平均的压至芯管表面，通过自身的弹性变形来确保补偿密封面的磨损，同时防止泄露。起决定性作用的是填料的物理属性—弹性和塑性，而在填料深度方向产生的径向力（py）和他所受的轴向力px不同。 其中μ是填料泊松比（也是横向变形系数，横向变形和纵向变形的比值）其中(µ/1-µ)也可以用k代替(侧压系数)根据这一特点，填料由单一的软性或硬质填料改为组合使用填料。比如硬填料在深一点的地方，软填料靠外一点。