1、并购价格问题
购买企业的行为其实跟去市场上买东西一样，卖方能够就是想方设法将自己的企业高价卖出，而买方则希望花费最小的成本购得。一般来说，成交价格的协商也是企业并购协商谈判的主要内容，与一般买卖的价格协商类似。
公司的成交价格往往高于公司的净值，此项差异主要是买方提供给卖方出让控制权的补偿。但是除了控制权因素外，买方通常在兼收并购前对目标公司的了解非常有限，而存在相当大的风险，因此，买方对未来预期的获利必大于提供卖方的此项“补偿”，才会乐于承担此项风险。
实际上，并购是一种非充分竞争。并购的价值不仅取决于企业本身值多少钱，很多时候还在于，在并购方心目中，被并购企业的使用价值是多少。
2、目标公司的债务问题
任何企业在经营活动中，都同时既是债权人也是债务人，目标公司也不例外。因此，并购之前一定要搞清楚目标公司的债权债务问题。目标公司有多少到期债务而不能履行，有多少债权尚未实现，其原因是什么？还有多少债务将被免除，有多少债权将无法实现。
3、员工安置问题
一些地区的民营企业进行并购时，常常见物不见人。在制定并购方案和计划时，忽视对企业职工权益问题的解决，以致在实施并购方案时阻力重重，最后不但导致一方或双方违约，而且还带出许多其他问题。因此必须全面考虑，制定方案时，要有专门团队、分工负责，同时要彼此协调，使方案全面而无遗漏！
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